- 병원체
일본뇌염바이러스는 positive ssRNA바이러스로 Flaviriridae과의 arbovirus B군에 속하며, 바이러스의 직 경은 40～50nm 정도의 정20면체이다. 세포증식이 비교적 느리며, 바이러스의 표면에는 감수성이 있는 세포에 흡착(adsorption)하는 항원이 있고 감염된 다음에는 혈구응집(HA)항체를 비롯하여 중화항체, 보체결합항체 등 의 여러 가지 항체가 나타난다. 에테르에 감수성이며 데옥시코올산 나트륨에 의해서 급속하게 불활성화된다. 단 백분해효소인 트립신에 의해서도 불활성화된다. 50℃에서 10분간 가열하면 생존율은 약 0.1%로 급속히 감소되 나 -70℃이하에서는 안정성이 유지된다. 동결건조하면 10년 이상 감염력을 유지한다. 2000배 희석 포르말린으 로 처리하면 5일 후에 생존율은 0.1%이하로 떨어진다. 일본뇌염바이러스의 혈청형은 하나뿐이다.
 
- 전파양식
바이러스를 가진 모기에 물리면 감염된다. 일본뇌염은 Culex속 모기(집모기)에 의해 매개되는데 모기는 야 생 조류나 일부 포유류로부터 감염된다. 주로 돼지가 바이러스의 증폭숙주로서의 역할을 하는 것으로 알려져 있 다.
 
- 증상 및 증후
불현성 감염이 대부분이다. 전구기(2∼3일), 급성기(3∼4일), 아급성기(7∼10일), 회복기(4∼7주)의 임상상을 보이며, 현성 감염인 경 우 급성으로 진행하여, 고열(39∼40℃), 두통, 현기증, 구토, 복통, 지각 이상 등을 보인다. 진행하면 의식장 애, 경련, 혼수에 이르며 대개 발병 10일 이내에 사망한다. 경과가 좋은 경우에 약 1주를 전후로 열이 내리며 회복된다. 합병증으로는: 연축성 마비, 중추신경계 이상, 기면, 진전 등이 있다.

- 진단 및 치료
병이 진행되는 동안 특이적인 IgM 항체를 검출하거나 급성기와 횝복기 혈청에서 IgG 항체가가 4배 이상 증가 하면 진단할 수 있다. 혈액이나 척수액 등의 검체에서 일본뇌염바이러스를 분리할 수도 있다. 일본뇌염에 대한 특이적인 치료법은 없고 호흡장애, 순환장애, 세균감염 등에 대해서는 보존적인 치료가 필요하 다.

※ 국립보건연구원 검사의뢰방법 - 담당부서 신경계바이러스과：전화 380-1498∼9, 전송 380-1499 - 검체 : 혈청 (1∼2 ml) ; 급성기(발병후 가능한한 빨리 채취)와 회복기(14일이후에 채취), 뇌척수액 (1∼2 mL) - 운송 : 바이러스 배양용 검체는 4℃를 유지하고 보관시는 -70℃가 좋으나 1주일 이내 운송하여 접종이 가능한 경우 -20℃에 보관이 가능하다. 항체검사용 혈청 : 4℃를 유지하여 보낸다. - 환자 관리 환자나 접촉자에 대한 격리나 특별한 조치는 필요없다.

- 예방
일본뇌염에 걸리지 않기 위해서는 기초접종(생후 12-24개월 1-2주 간격으로 2회, 기본접종후 12개월 뒤 1 회 접종) 및 만6세, 12세에 각각 1회씩 추가 접종을 한다.
 
- 예방 접종
기초접종(생후 12-24개월 1-2주 간격으로 2회, 기본접종후 12개월 뒤 1회 접종) 및 만6세, 12세에 각각 1 회씩 추가 접종을 한다.

- 전염병 신고
1) 신고범위 : 환자, 의사환자
2) 신고시기 : 즉시 신고
3) 신고를 위한 진단기준
○ 환자 : 일본뇌염에 합당한 임상적 특징을 나타내면서, 다음 검사방법 등에 의해 해당 병원체 감염이 확인된 자 - 검체(뇌조직, 뇌척수액 등)에서 바이러스 분리 - 회복기 혈청의 항체가가 급성기에 비해 4배 이상 증가 - 특이 IgM 항체 검출 - 검체(뇌조직, 뇌척수액 등)에서 바이러스 항원 검출 - 검체(뇌조직, 뇌척수액 등)에서 바이러스 유전자 검출
○ 의사환자 : 임상적 특징 및 역학적 연관성을 감안하여 일본뇌염임이 의심되나 검사방법에 의해 해당 병원체 감염이 확인되지 아니한 자